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摩托车改色之后，如果没有备案，会处以警告以及200元以下的罚款处罚。根据《机动车登记规定》第七十八条第五项；改变车身颜色、更换发动机、车身或者车架，未按照第十六条规定的时限办理变更登记的由公安机关交通管理部门处警告或者二百元以下罚款。

车辆改色如果超过了整车的30%，那么在车辆变更之后的10日之内就应该及时向车管所提交变更申请，主要是填写车辆的变更登记申请表，同时需要提交驾驶人的身份证原件和复印件，行驶证以及车辆登记证书，车管所会对车辆进行检验，申请通过之后就可以备案并领取新的行驶证。