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新车上牌的时候，车辆合格证原件是要交给车管所的。在车管所办理上牌手续时，他们会把合格证收走存档，所以车主最后手里不会有原件了。新车落户时车管所要留下的材料包括：车辆合格证、购车发票的第四联、购置税的副本、交强险的副本、身份证复印件。这些都会作为车辆档案存放在车管所。车管所收走合格证后，会发给车主一本机动车登记证书。

车管所的主要工作是维护机动车和驾驶员管理的电脑系统，确保系统安全和正常运行，还要定期备份数据库。他们还会按照规定处理机动车和驾驶员的信息查询业务。