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摩托车三年没年检的话，现在去补检是可以的，不过要被罚200元以内，扣3分。具体来说：

1. 根据《机动车登记规定》第五十六条第四项，如果车辆没按时参加安全技术检验，会被处以警告或200元以下罚款。

2. 《道路交通安全违法行为记分分值》第三条第十二项规定，驾驶没按期年检的摩托车上路，一次扣3分。

注意：这里只说明了补检的法律后果，但实际处理可能因地区执行差异而不同，建议尽快处理避免更麻烦。