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摩托车违章分三种情况：

1、骑摩托车的人有摩托车驾驶证，这时候和汽车驾驶证没有关系，各管各的。摩托车违章就扣摩托车驾驶证的分；

2、骑摩托车的人没有摩托车驾驶证，只有汽车驾驶证，这时候就有关系了，属于准驾不符，汽车驾照会被扣9分；

3、还有第三种情况，如果驾照属于C1驾照和摩托车驾照合一，则会扣C1驾照分。

根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》规定机动车驾驶人有下列交通违法行为之一，一次记9分：

（一）驾驶7座以上载客汽车载人超过核定人数百分之五十以上未达到百分之百的；

（二）驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之五十以上的；

（三）驾驶机动车在高速公路或者城市快速路上违法停车的；

（四）驾驶未悬挂机动车号牌或者故意遮挡、污损机动车号牌的机动车上道路行驶的；

（五）驾驶与准驾车型不符的机动车的；

（六）未取得校车驾驶资格驾驶校车的；

（七）连续驾驶中型以上载客汽车、危险物品运输车辆超过4小时未停车休息或者停车休息时间少于20分钟的。