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机动车发动机更换后，发动机更变挡案的方法如下：

1、首先需要准备材料，包括车主身份证原件和复印件；

2、还有车辆更换发动机的证明、发动机号拓印件、汽车信息变更申请单、行驶证、驾驶证；

3、然后去车管所开具验车申请，携带车管所给好的材料和之前准备的材料，等待验车；

4、车验好后要照相留挡，等照片拿到手后去大厅办理挡案变更手续，就会有新的机动车登记证书和行驶证了。

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机动车发动机更换后，发动机缸体上的发动机号会改变，需要去车管所办理发动机变更挡案就可以了。

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一般机动车发动机更变后，需要带上相关证件到当地的车管所来更变挡案的，如没有到车管所更变的，被查到会被罚款和拘留的。