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高速公路过路费发票，增值税按以下公式计算抵扣：

1、高速公路通行费可抵扣进项税额=高速公路通行费发票上注明的金额÷（1+3%）×3%；

2、高速公路过路费发票的作用：当作企业的费用支出，用报销凭证对发票汇总统计，可以用来抵公司的利润的，因为所得税就是根据利润来交税的，所以也可以理解为发票是可以抵减利润的；

3、目前，高速公路过路费不可以开增值税专用发票，但可以凭高速公路过路费的票据计算抵扣。

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高速公路通行费可抵扣进项税额=高速公路通行费发票上注明的金额÷（1+3%）×3%一级公路、二级公路、桥、闸通行费可抵扣进项税额=一级公路、二级公路、桥、闸通行费发票上注明的金额÷（1+5%）×5%通行费，是指有关单位依法或者依规设立并收取的过路、过桥和过闸费用。

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一般纳税人收取试点前开工的一级公路、二级公路、桥、闸通行费，可以选择适用简易计税方法，按照5%的征收率计算缴纳增值税。