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黑牌车的申请流程是这样的：

1、如果你是在广东山区投资实业的境外、港澳或台湾企业，实际投资额超过40万美元（约320万港元或人民币），或者在非山区投资超过100万美元（约800万港元或人民币），在合同有效期内，每家企业可以申请1辆港澳私家车进入内地的行驶牌照；

2、如果是在广东投资澳门私家车的话，实际投资额只要达到40万美元（约320万港元或人民币）以上，在合同有效期内就能每家申请1辆澳门车进内地；

3、特别大的投资企业（比如投资额特别高的），可以适当多申请一些港澳车辆的牌照指标；

4、另外，如果在广东山区投资超过500万美元（约4000万港元或人民币），或者非山区投资超过800万美元（约6400万港元或人民币），合同有效期内能申请2辆香港私家车的内地行驶牌照。

注意这些条件都是基于实际投资额和合同有效期，不同地区（山区或非山区）的门槛金额也不同。