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车辆超员50%要扣12分，罚款500到2000元。根据《道路交通安全法》第五十五条的规定：开营运客车（不包括公交车）、校车的时候，如果超载人数超过核定人数的20%，就会被扣12分，罚款500到2000元。以下是具体的法律规定：1、长途客运车坐人超过核定人数的，罚款200到500元，并且交警会扣留车辆直到超载问题解决；2、客车超载但没超过20%的，扣6分；超过20%的，直接扣12分；3、货车超载30%还违规拉人的，罚款500到2000元，还要扣6分。