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车辆超员50%要扣12分，罚款500到2000元。根据《道路交通安全法》第五十五条的规定：开营运客车（不含公交车）或者校车，如果超载人数超过核定人数20%以上，直接扣12分，罚款500到2000元。

以下是具体规定：

1、长途客车超载乘客的，罚款200到500元，交警会扣留车辆直到违法情况处理完；

2、客车超载没超过20%的，扣6分；超过20%的，直接扣12分；

3、货车超载30%以上还违规拉人的，罚款500到2000元，并扣6分。