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超员50%直接扣12分，罚款500到2000元。根据《道路交通安全法》第五十五条的规定，开营运客车（不含公交车）和校车的时候，如果超载人数超过核定人数的20%，就会被一次性扣12分，罚款500到2000元。具体来说：

1. 公路客运车辆如果多载乘客，不管超了多少，先罚200到500元，然后交警会扣留车辆直到超载问题解决；

2. 客车超载但没超20%的，扣6分；超过20%的，直接扣12分；

3. 货车如果超载超过核定质量30%，还拉了人，就要罚500到2000元，同时扣6分。