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摩托车登记证书丢了的话，直接去车管所补办就行。根据《机动车登记规定》第43条，如果证书丢失、损毁或者弄丢了，车主需要到当地车管所申请补领或换新。申请的时候带上自己的身份证就行。补充说明：车辆登记证书是证明车子归属的重要文件，由车主自己保管，不用随车带着。以后不管是转户、过户还是办其他手续，都必须带上它，上面还会记录车子的各种信息，就跟车子的户口本差不多。