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违章扣50分以上的处理流程是这样的：1、扣分超过50分，驾驶人得先参加7天的道路交通安全法规学习；2、学习结束后20天内要考科目一理论；3、考试通过才能清除分数、拿回驾照。要是没通过考试，就得继续学和考。补充说明几个关键点：1、一个记分周期内两次以上扣满12分，或者总分超过24分的驾驶人，在考过科目一后10天内还要加考科目三。科目三考试按你驾照上写的最高准驾车型来考。2、如果一个记分周期内扣分没到12分，但罚款已经交了，分数就会清零；如果罚款没交完，剩下的分就会带到下一个记分周期里。