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米勒循环和阿特金森循环的区别是这样的：阿特金森主要是靠各种机械结构让活塞的行程变长变短，而米勒循环则是通过延迟关闭进气门来实现的。米勒循环结构简单，用不着复杂的连杆机构，但阿特金森循环必须用这些机构。

具体来说，阿特金森发动机工作原理和普通内燃机差不多，都是进气、压缩、做功、排气四个步骤。不过它的特殊之处在于压缩行程比做功行程短，所以压缩比比膨胀比要低。举个例子，压缩时活塞还没跑到最高点，气缸里的气体就提前开始膨胀做功了，这样能提高热效率。