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摩托车报废或者彻底损毁了，要办灭失证明得去车管所，具体流程是这样的：

1. 申请注销流程：车主得去当地车管所提交注销申请，填个表格，还要带齐这些材料——机动车登记证、行驶证、车主身份证，以及能证明车真的没了的灭失证明。

2. 自然灾害导致车报废：比如地震、台风之类的天灾，得找发生地街道办、乡镇政府或者更高一级的政府部门开证明，说明车是因为这次灾害损毁的。

3. 火灾导致车报废：要是车是因为失火烧毁的，需要找火灾发生地的县级及以上消防部门开证明，证明车确实是这场火给烧没的。

4. 交通事故导致车报废：如果是因为车祸导致车彻底报废了，得找发生地的县级及以上交警部门开证明，说明车是因为这次事故灭失的。

注意每种情况对应的证明单位都不一样，别搞错了地方！