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摩托车违章没处理确实会影响正在考的C1驾照。在违章没处理完之前，你拿不到新驾照。具体分两种情况：

1. 已经有C1驾照的人：

- 如果是电子眼拍到的违章，只交摩托车罚款就行，不影响C1驾照年检；

- 但如果被交警现场抓到，并记录了身份证或驾照号，不交罚款的话，C1驾照换证时就会被卡住。

2. 还没拿到C1驾照的人：

- 如果已经在驾校报名学车，考科目二、三时不受影响；

- 如果已经考完科目四，车管所会等你处理完违章后才发驾照。

简单说就是：考C1时，摩托车违章不处理，最后拿驾照时可能会被拦下来，得先处理完违章才能拿到手。