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MT手动挡和AT自动挡的区别主要分四点：

1. 变速器类型不同：MT用的是手动变速箱，AT用自动变速箱。

2. 结构和操作方式不同：手动挡主要靠齿轮和轴换挡，通过齿轮组合调整速度和扭矩；自动挡则用液力变扭器、行星齿轮和液压系统，靠液体传动和齿轮组合来变速。

3. 开起来的操作区别：开AT车不用踩离合器，换挡时操作简单平顺，档位也少；但开MT车得自己控制离合器，根据车速不断加减挡，操作复杂一些。

4. 反应速度不同：自动挡对速度变化的响应不如手动挡灵敏，比如起步或者急加速时，手动挡能更快跟上驾驶者意图，自动挡会稍微慢半拍。