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摩托车驾照和C1驾照不能分开持有。根据交管部门的要求，驾驶员要是想考取两种以上的准驾车型，只能拥有一本综合驾照。简单来说，如果你先考了摩托车D照，后来又考了C1汽车驾照，这两个证件会被合并到同一本驾照里，而不是分别拿两个小本本。

这里有个重点要注意：两证合并后扣分是共享的。原本C1驾照有12分，摩托车D照也有12分，合并之后总分还是12分。不管是骑摩托车还是开汽车，违章扣分都从这12分里扣。要是分扣完了，不管是哪种车型都不能继续开，得重新参加学习考试才能恢复驾驶资格。