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导航所提示的超速通过是有一定依据。但至于会不会扣分则看超速的程度。根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》规定，家庭用车超速百分之二十以内不会扣分，但有可能会收到警告或罚款。超速超过百分之二十低于百分之五十者，会被处罚款和扣六分的惩罚。超过百分之五十，则直接扣12分。

根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》规定，关于超速，按具体情况区别，确定具体扣分标准。

1、驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速百分之二十以上，或者驾驶其他机动车在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速百分之五十以上的，记12分。

2、驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之五十以上的，记9分。

3、驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速未达到百分之二十，或者在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之二十以上未达到百分之五十的，记6分。

4、驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆以外的机动车在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速百分之二十以上未达到百分之五十，或者在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之五十以上的，记6分。

5、驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆以外的机动车在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之二十以上未达到百分之五十的，记3分。

6、驾驶机动车在高速公路上行驶低于规定最低时速的，记3分。

7、驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之十以上未达到百分之二十的，记1分。

超速是一种很危险的行为，稍不注意就会引发严重的交通事故，造成极大的损害。而在这一情况下，就有可能演变为刑事犯罪，行为人除了要承担交通行政责任、民事赔偿责任以外，还需要承担刑事方面的责任。根据《刑法》中的规定，此时最严重的可以处7年以上有期徒刑。