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科目三补考费是可以自己去车管所交的。具体来说就是：

1、每次考试只给一次补考机会。如果补考还是没过，那这次考试就彻底结束，得重新预约考试。不过科目二、科目三得等满十天才能重新约考；

2、科目三的安全文明常识考砸了，之前通过的路考成绩不会作废；

3、科目二和科目三路考在有效期内最多只能约考五次。要是第五次还挂了，之前考过的科目成绩就全没了。

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可以直接在考场交，交完会给你收据的。或者你也可以去驾校交，你下次考科三的时候，考完科四之前肯定会让你交补考费。现在你继续约考科三就行。一般补考费不交的话不让考科四，因为科四本来就没有补考费这一说。

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通常都是驾校帮收的。根据《机动车驾驶证申领和使用规定》里的条款，每个考试科目第一次补考是免费的，第二次补考才会开始收费。