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摩托车不按时年检会有处罚。根据规定，机动车没按时参加检验，会被警告或者罚款。如果驾驶没按时年检的摩托车，会被扣3分，车可能被暂扣到处理完违法状态为止。以下是详细说明：

1、强制报废规定：根据《机动车强制报废标准规定》第四条，已注册的摩托车在检验有效期到期后连续3个检验周期内没通过年检，必须强制报废。车主得把车交给有资质的报废回收企业处理，并注销相关证件。

2、年限新规定：新规允许各省市根据本地情况制定更严格的年限标准。但小、微型出租客运车（纯电动车除外）和摩托车的最低年限不能低于国家规定：小、微型出租客运车至少6年，正三轮摩托至少10年，其他摩托至少11年。