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机动车发票有六联。根据《国家税务总局关于使用新版机动车销售统一发票有关问题的通知》国税函2006479号文件规定，《机动车销售统一发票》为电脑六联式发票。

第一联发票联购货单位付款凭证，第二联抵扣联购货单位扣税凭证，第三联报税联车购税征收单位留存，第四联注册登记联车辆登记单位留存，第五联记账联销货单位记账凭证，第六联存根联销货单位留存。当购货单位不是增值税一般纳税人时，第二联抵扣联由销货单位留存。