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AT变速箱和手自一体变速箱的区别主要有三点：1、操作模式不一样。手自一体有手动和自动两种模式可选，你既可以直接控制挡位，也能交给电脑处理；AT变速箱只有自动模式，不能手动换挡。2、功能设计不同。手自一体变速箱同时具备手动和自动的功能，手动模式下你能自己决定换挡时机；普通AT变速箱完全由电脑控制换挡，驾驶者没法干预。3、构造结构有差异。手自一体变速箱的结构包括普通齿轮箱、电子控制离合器、自动换挡机构和电子控制系统等；而普通AT变速箱主要是液力自动变速箱的结构。