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开摩托车灭失证明得去车管所办理。具体需要准备车主身份证原件、摩托车出厂合格证，还得先到辖区派出所开车辆丢失报案回执。把这些材料带齐后，就近找车管所就能申请开具灭失证明了。有了这个证明，后续就能办理销户手续。这里说的灭失证明，其实就是车辆被盗抢或意外损毁的官方认定文件。

不同情况需要找不同部门开证明：要是摩托车被烧毁了，得找火灾发生地的县级及以上消防部门开认定书；要是交通事故导致车辆报废，就要找事发地县级以上的交警大队开事故车辆灭失证明。

关于摩托车灭失销户的具体操作，主要分这几步：

1. 带齐车辆登记证书、行驶证、驾驶证，如果车牌还在得先做挂失备案。然后写份车辆丢失情况说明，让派出所出具灭失证明。最后带着这些材料去车管所填表申请销户。

2. 要是派出所开不了证明，可以试试找居委会开证明并盖章。实在啥材料都没有，只带着身份证去车管所咨询也行。现在车管所都有绿色通道，和工作人员说明实际情况，他们会根据具体情形帮你走特殊流程办理注销的。