东方标致408变速箱采用的是日本爱信品牌变速箱，新408标配第三代6速手自一体式变速箱，同时低配车还有5速手动变速箱可选。也就是说标致408的变速箱分手动档和自动档，手动档装的变速箱型号是五档箱<BE4>。自动档装的型号是爱信AT6的6速箱，提供了经济、动力、雪地、手动4种智能模式选择，满足不同路况的驾驶需求。在不同路况及驾驶条件下，兼顾动力与平顺、操控与油耗。宽阔的变速器速比范围，使发动机在任何工况下都能选择最适合的挡位进行工作，极大提高燃油经济性。

同时“第三代6速手自一体变速箱”的设计还体现了高智能化，根据驾驶员的操作与车辆的状态实现最优的挡位选择与控制，如坡道逻辑控制、弯道挡位保持控制，使行程过程舒适、便捷、安全，提升了驾驶乐趣；同时保证换挡顺畅、敏捷，实现了行驶动力与快速响应的完美结合，在节能、平顺、静音等多方面都有非常优异的表现。