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解除驾驶证在运输公司备案的操作指南：

1、线上平台自助操作：直接登录「交通安全综合服务管理平台」，进入用户信息管理页面，找到「绑定机动车」选项。在已备案的车辆列表里，选中需要解除关联的公司车辆，点击解除绑定即可完成操作。

2、手机APP快速办理：下载最新版交管12123APP（安卓用户建议使用2.6.2版本），用本人账号登录后，点击首页的「备案非本人机动车」功能。进入页面后点击右上角「备案记录」，此时会显示所有绑定过的车辆信息，找到对应的公司车辆，直接点击「解除备案」按钮就能立即生效。

3、线下窗口人工办理：如果线上操作不熟练，可以带着身份证原件、本人驾驶证以及公司车辆行驶证，直接到就近的车管所业务大厅。跟工作人员说明解除备案需求，提交材料后一般十分钟内就能办好，现场还能拿到纸质回执作为凭证。