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摩托车被交警扣留后，确实可能影响到你的C1驾照。这里咱们得具体说说几个关键点：

第一，如果现场查到摩托车违章，交警不仅会登记驾驶证信息，还会关联你的身份证号。这个记录就像在你的驾驶档案里做了重点标记，后续换证时肯定绕不过去。

第二，要是你的摩托车驾照和C1驾照合并成一个证（现在很多地方都这么操作），等到换证的时候，必须先把所有违章记录处理干净才能顺利换证。不过有个特殊情况要说明：如果是电子眼拍到的违章没处理，虽然暂时不影响你开小汽车，但等到年审或换证时照样得补缴罚款。

第三，最关键的是扣分规则。合并后的驾照总共就12分家底，不管是骑摩托还是开汽车，扣分都从这同一个池子里扣。比如骑摩托闯个红灯扣6分，那剩下的分数C1驾照也只能用6分了。这点在《机动车驾驶证申领和使用规定》第71条写得明明白白：交管部门除了罚款，还会实行累积记分制，一年周期内总共就12分额度。

简单来说，现在很多地方都把不同车型的驾照合并管理，这种"一证通"确实方便，但违章成本也跟着变高了。平时骑摩托上路千万注意，别让两轮车的违章拖累了四轮车的驾驶资格。