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机动车登记证书丢了只能去车辆注册地的车管所补办。以下是具体流程和材料清单：

1. 需要带的材料：

（1）个人车主：本人身份证原件和复印件，如果是外地户口还要带上居住证和复印件。

（2）单位车主：单位组织机构代码证原件、经办人身份证原件，还要准备盖了单位公章的委托书。

2. 注意事项：

补办时必须把车开到车管所。如果是个人补办，必须本人亲自到场，不能找人代办。如果车主因为死亡、出国、重病或自然灾害等特殊情况不能到场，需要先开相关证明，再拿着公证过的委托书和车主的书面委托，才能让代理人代办。