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菱智M5和M3的区别主要有三点：

1. 发动机不一样：M5用的是1.6L自吸发动机，M3用的是2.0L自吸发动机。

2. 车身尺寸有差异：M5长宽高分别是5145mm、1720mm、1960mm，轴距3米；M3则是5115mm长，宽高和M5一样，但轴距短了点，只有2810mm。

3. 座椅布局不同：M5是4门6座的商务MPV，M3同样是4门但多了一个座位，是7座的商务MPV。